Инспекторы сравнят сумму удержанного налога на доходы физлиц в расчете 6-НДФЛ с суммой перечисленного НДФЛ — хотя такого контрольного соотношения в письмах ФНС нет. На практике же инспекторы сопоставят сумму удержанного НДФЛ по строке 070 раздела 1 расчета 6-НДФЛ с суммой фактически перечисленного НДФЛ, и если есть расхождение, инспекция запросит пояснения.
Равенства может не быть и по объективным причинам — например, если в отчетном периоде вы возвращали сотруднику излишне удержанный налог, то показатель в строке 070 не сойдется с суммой налога, который перечисляли в бюджет.
Так что составьте пояснения в свободной форме и представьте в течение пяти рабочих дней после получения требования (п. 3 ст. 88 НК). Если проигнорировать требование или ответить позже, компанию оштрафуют (п. 1 ст. 129.1 НК).